制藥用水系統檢測取樣時，所有取樣品應具有代表性。取樣器具應事先進行消毒，收集樣品前，充分沖洗。含有化學消毒劑的樣品在中和后方可進行微生物學分析，用于微生物學分析的樣品均應處于保護之中，在取樣后或者立刻進行微生物檢測，或者存放至測試開始以前。
1.安裝確認IQ：設備、管線安裝后，對照設計圖紙和供應商提供的技術資料，查驗安裝是否符合設計要求和設備技術規格。
安裝確認需要涵蓋制水設備和分配系統。驗證的主要內容包括：共用設施的支持是否到位，設備是否符合技術規格，材質、管道坡度、焊縫、盲管長度、儲罐及部件等是否符合設計要求，儀器儀表是否校驗，資料是否齊全等。
2.運行確認OQ：是在水處理設備全部開啟的情況下，檢查設備的各個功能是否運行正常，并測試設備的參數。
驗證的內容包括：設備/系統各部分的功能；產水量、產水速度是否達到設計要求；閥門、控制裝置是否正常；管道是否泄漏，是否耐壓；指示器、在線測試儀及報警器是否正常等。
3.性能確認PQ：性能確認主要是通過對所有取樣點的水質檢驗，來確認整個水系統的運作是否符合設計要求，水質是否持續符合質量標準。
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